耳、鼻、咽部拭子细菌培养包括耳拭子采样、鼻拭子采样、咽部拭子采样，检查过程也有所不同。
1.耳拭子采样：患者取侧卧位或者坐位，头偏向一侧，医生将一次性无菌棉拭子从外耳道深入病灶处，用力旋转摩擦后取出，当感染发生在内耳时，需借助器械进行采样。
2.鼻拭子采样：患者取卧位，将头仰起45度，医生将一次性无菌棉拭子从鼻孔插入，左右旋转3次后取出。
3.咽部拭子采样：患者取坐位，漱口后先将头仰起，并张嘴尽可能将舌头往外伸，医生将一次性无菌棉拭子越过舌根到咽后壁，反复涂抹后放入转运培养基中。