脊髓空洞症的临床症状主要包括感觉障碍、运动障碍、神经营养性障碍及其他症状等，脊髓空洞症发病年龄通常为20-30岁，多起病隐匿，进展相对缓慢，主要临床表现为感觉障碍，患者最早出现的症状常是相应支配区自发性疼痛，继而可出现痛温觉丧失，而触觉和深感觉则相对正常。
除此以外，脊髓空洞累及前角细胞还可出现运动障碍，表现为病变相应节段的肌肉萎缩、无力、急速颤动等症状，患者还可出现皮肤营养障碍，可见皮肤增厚、过度角化，痛觉消失区的表皮烫伤、外伤，可造成顽固性溃疡及瘢痕形成。