人感染禽流感的原因主要是人直接或间接感染禽流感病毒，目前可将甲型流感病毒分为9种N亚型、16种H亚型，病毒在哺乳类动物、家禽、人类之间传播。机体免疫力低下的人群更易感。
人感染禽流感是由禽甲型流感病毒某些亚型中的一些毒株引起，其中的H5N1亚型可引起高致病性禽流感。禽流感病毒可在家禽流行，与多个病毒频繁重排，增加了基因重排的可能；基因含有多个突变位点，增加了对人宿主细胞唾液酸受体的辨识度，增强其对人的感染能力。