肾结石形成的原因有很多，可能与性别、种族、遗传、结石体质、环境因素、饮食习惯和职业有关。但是常见的原因有：身体的代谢异常，譬如身体内生成的尿酸增多，代谢不出去，就可能会形成尿酸结石；尿量减少，造成体内形成结石成分浓度升高。尿液的排出不畅，导致尿液滞留，促进结石的形成。尿路炎症也可以促进结石形成。某些药物也可以引起肾结石，譬如磺胺类药物、维生素C以及维生素D等。