1、口腔专科临床检查：通过舌扁平苔藓的临床特点可初步诊断，如舌乳头萎缩、红亮光滑、灰白色、透蓝的斑点状丘疹或斑块、网状条纹，充血、糜烂、溃疡、萎缩和水疱等症状。
2、组织活检：通过对病损区域的组织进行局部切除，病理分析，通过病理结果确诊。扁平苔藓显微镜下的典型表现为过度角化和不全角化，皮肤损害以过度角化为主，口腔黏膜损害以不全角化为主。
3、过敏试验：排除是否由于过敏引发扁平苔藓。