病毒性脑膜炎绝大多数预后良好，可以治愈。细菌性脑膜炎经过有效的抗生素治疗，多数都可以治愈。结核性脑膜炎如果诊断及时，经过规范全程的抗结核治疗，大部分都可以治愈。真菌性脑膜炎比较难治疗，容易反复和迁延，预后比较差。本身我们人有一套完整的免疫系统，避免各种致病性进入体内，真菌进入脑内发生的比较少，一旦发生往往提示可能血脑屏障出了问题，或者自身免疫力出现严重的下降。真菌往往是比较顽固的，很多药物针对真菌的药，不是特别有效力，不如抗生素有杀伤力。另外，很多抗真菌药比较难到脑里面去，这就造成了真菌性脑膜炎比细菌性脑膜炎更难治。