男性尿道癌目前可选择的治疗方法包括手术切除肿瘤、化学治疗和放射治疗，如肿瘤局部切除、尿道部分切除或阴茎部分切除术等。该病情无明确治疗周期，确诊后需长期治疗。
一、药物治疗
1、对远处转移的男性尿道癌以化疗为主，目前无统一的治疗方案，应根据病理类型选择相应化疗方案。
2、对移行细胞癌有效的化疗药物有甲氨蝶呤、长春碱、阿霉素、顺铂、氟尿嘧啶、环磷酰胺等。常用的化疗方案主要有甲氨蝶呤加长春碱、阿霉素、顺铂，及顺铂加氟尿嘧啶等方案。
二、手术治疗
1、肿瘤局部切除：适用于尿道单发、表浅的肿瘤，可采用经尿道电切、电灼或激光治疗，尿道外口处肿瘤可行局部切除术。
2、尿道部分切除或阴茎部分切除术：适用于尿道远侧1/2的低分期癌。
3、根治性尿道切除：适用于近段尿道癌及位于尿道球部或膜部者，切除范围包括全尿道和阴茎脚。
4、根治性广泛脏器切除：切除范围包括阴茎、尿道、阴囊、精索、膀胱、前列腺整块切除，有时需行切除睾丸。
5、淋巴结切除术：凡触及腹股沟淋巴结者，应施行规范的淋巴结切除术。若行膀胱前列腺整块切除，应同时切除盆腔淋巴结。
三、放射治疗
男性尿道癌放疗的主要目的是保存器官，主要用于局部晚期，有区域性淋巴结转移的患者，有全身远处转移而需要做姑息治疗的患者，不适合手术治疗的患者。效果取决于肿瘤部位和大小，前尿道癌优于后尿道癌。体外照射治疗对男性早期前尿道癌有较好的疗效。