掌跖脓疱病容易反复发作，一般治疗效果差，也有部分能够治愈。发病的原因以及加重的原因是非常多的，目前对于掌跖脓疱病的治疗分为局部治疗、系统治疗以及光疗。局部可以用皮质类固醇的激素、维甲酸类的外用药，以及卡泊三醇的外用药来治疗。口服制剂包括大环内酯类的抗生素或者是米诺环素，也可以口服阿维A治疗。严重的也可以应用小剂量的环孢素，以及氨苯砜、秋水仙碱等抑制嗜中性白细胞趋化的药物。也可以用长波的紫外线治疗，或者是窄波的中波紫外线治疗。