细菌性痢疾患者，大便常规外观呈现黏液脓血便或者黏胨样便，粪质比较少，镜检可以看到大量的白细胞、红细胞、吞噬细胞等等。在应用抗生素之前，可以取新鲜的脓血便标本做细菌培养，尽早及多次送检可以提高细菌培养的阳性率。用PCR方法检测便中的细菌核酸，有早期快速的优势，且适用于在应用抗生素治疗后的患者大便标本检测。