早晨起来舌头有齿痕，可以到正规医院的口腔科进行检查，看看是否有口腔疾病。如果由口腔黏膜病引起的，可以进行相应的口腔黏膜原发病的治疗。
如果发现口腔黏膜疾病还伴有其它全身性疾病，可以在治疗口腔黏膜病的同时，对全身性疾病进行治疗，例如引起齿痕的，可能有舌乳头的炎症，可以进行舌乳头炎症的治疗。也有可能是有维生素缺乏、未控制的糖尿病、慢性肾炎、尿毒症、甲状腺功能减低，都需要到相应的科室进行检查、诊断和治疗，比如糖尿病的到内分泌科，肾炎、尿毒症需要到肾内科，甲状腺功能减退也需要到肾内科进行治疗。如果没有全身系统性疾病，可以到正规医院的中医科或者大型的中医院进行调理，因为中医认为舌胖大，有齿痕，为气虚水湿停滞，可以健脾利湿。