卵巢囊肿3cm谈不上严重，正常女性在月经周期的中间会出现生理性囊肿，比如卵泡、黄体都有可能形成一个3cm左右的囊肿。这种情况非常普遍，属于生理现象，在月经周期的过程中它会出现，也会自行消失。
怎么区别是生理性的囊肿，还是病理性的囊肿，需要在来月经的第3-7天之内做超声检查。如果连续三个月检查，发现卵巢囊肿持续存在，有可能是病理性囊肿。如果囊肿在月经周期的早期消失，说明它是生理性囊肿，不需要特殊的处理。