小儿的细菌性肠炎用药先要明确检查，比如便常规，还有粪便的细菌培养。如果具有条件，需要等药物细菌培养的结果出来之后，有针对性的应用抗菌、消炎类药物，治疗肠炎的效果会比较好。
由于这个检查的时间比较长，也可以先使用头孢三代抗生素，进行抗菌的治疗，一般情况下用药在3-7天左右就可以见效。如果效果不好了，需要结合之前的细菌培养结果调整用药，然后还有些腹痛或者腹泻的症状可以对症治疗，使用思密达或者蒙脱石散这类的止泻类药物。