从以下三个方向来进行判断腰疼还是肾疼：
1、询问病史：有没有腰扭伤或者是长期固定姿势的病史；
2、体格检查：主要是做肾区的叩击痛试验，患者取站立位、坐位或侧卧位，检查者用左手掌平放于患者的肾区，右手握拳用由轻到中等强度的力量向左手背进行叩击；
3、辅助检查：包括超声、CT、核磁等等。
可以通过以上方法判断病人肾脏有没有结石、有没有囊肿、有没有肿瘤，另外看看脊柱有没有问题等等，来判断病人到底是腰痛还是肾痛。