肾结核的治疗方法分为以下两种：
一、内科保守治疗。由于肾结核发生后破坏不明显，会表现为脓尿、血尿，肾功能正常，可以进行抗结核治疗6-9个月或者一年左右的时间，肾结核可以逐渐地恢复而达到治愈；
二、一旦肾结核病变发生后破坏严重，会造成对侧的肾积水，以及慢性的膀胱炎症等情况时，病变的肾脏肾功能基本丧失，就需要进行抗结核治疗，三周后考虑肾脏的切除。在切除肾脏后，仍然需要继续抗结核治疗3-6个月，并且在治疗的过程中要观察肾功能和尿液的改变。