神经系统查体主要包括检查意识，包括意识水平和意识内容。意识水平包括清醒、嗜睡、昏迷，意识内容包括谵妄等。还可包括检查智能状态，包括时间定向、人物定向、计算力和记忆，普通常识。
部分患者还需要进行颅神经检查，包括12对颅神经检查。还有四肢的肌力和肌张力检查，以及锥体外系检查、共济检查、深反射浅反射、病理征和脑膜刺激征等。