体检检查肛门主要是为了检查是否有肛门周围以及直肠下端的一些疾病，特别是直肠占位性疾病，包括肿瘤、息肉等等。
目前由于饮食结构的改变，大肠肿瘤的发病率越来越高，其中多数的大肠肿瘤是位于直肠，而多数的直肠肿瘤位于直肠下端，可以通过肛门指诊触及肿块，特别是对于家族内有大肠肿瘤病史的人群，以及平时有便血、大便习惯改变、黏液便等临床症状的人群，在体检时均应常规行肛门指诊检查，以排除这些疾病。