胆囊收缩素偏低的主要原因是乳糜泻病变在小肠上部，乳糜泻是患者对麸质(麦胶)不耐受，引起小肠黏膜病变为特征的一种原发性肠源性吸收不良综合征，病变在小肠上部时，可导致CCK水平降低。
明确诊断是由于小肠上部的乳糜泻病变引起，患者需要坚持去麸质饮食，是目前唯一有效的治疗方案，尚无有效药物方案。
去麸质饮食需要严格避免含麸质蛋白质(即面筋)产品，避免小麦、大麦和黑麦，但现实中无法避免，故目前定义其为饮食中所含麸质蛋白水平极低不会导致病变，目前认为<10mg/d的麸质饮食较为安全。