儿童患了手足口病可出现发热，咳嗽流涕，食欲不振，恶心，呕吐，头痛。口腔可出现疱疹甚至溃疡，患儿可出现疼痛，哭闹不安，拒食流涎等。重型的手足口病可出现神经系统受累，呼吸和循环功能障碍，患儿除了发热可有肌阵挛，肢体抖动，急性弛缓性麻痹，神经源性肺水肿等。特别是感染了EV-71的患儿病情凶险,可能出现死亡或者留有后遗症。