系统性红斑狼疮属于自身免疫性疾病，发病原因并不十分明确，可能和遗传背景，生活环境，病毒细菌感染等因素相关，不是单一因素导致的。直系亲属有系统性红斑狼疮患者的，发病风险比普通人高几十倍，一些药物可以诱导自身抗体产生，如青霉素、磺胺类等，一些研究表明，狼疮的发病和感染因素相关，一些物理因素如紫外线照射可以诱发皮疹等，内分泌因素即雌激素在发病中有重要作用。