睑板腺癌恶性程度高，容易复发和转移，手术治疗是主要治疗方法。其次化疗、放疗、冷冻治疗、生物治疗也起到一定作用。
一、手术治疗
手术切除是睑板腺癌目前最主要的治疗方法，及早完整切除对于患者预后起着非常重要的作用。手术切除术后会造成脸板缺损，影响美观，眼睑重建也是睑板腺癌治疗的重要环节。术后医生会建议联合放疗、化疗，以免肿瘤复发或转移。
二、化学药物治疗
化学药物治疗，可考虑选用5-氟尿嘧啶等。
三、物理治疗
冷冻治疗：可起到一定作用，但是只限于特定阶段的病例，处于辅助地位。
四、其他治疗
免疫治疗和基因治疗：是目前新兴的治疗方法，未来需要更多的数据证明其疗效。