葡萄球菌性食物中毒不能早期筛查，但是能够通过注意食物卫生及清洁，以及正确的储存食物来预防。
（1）注意意食物卫生及清洁，保持厨房清洁，并且注意清洁食物的方法，有效去除食物自身所带细菌，并且注意烹饪者自身清洁、卫生。
（2）正确的储存食物，蔬菜、水果等食物如果不立即食用，需要放到冰箱储存，对于剩菜剩饭应该同样放至冰箱储存。食品放置时间最好不要超过6小时，尤其是气温较高的夏秋、季节。
（3）严格的采购食品，禁止采购腐败变质、油脂酸败、霉变、生虫、污秽不洁、混有异物或者其他感官性状异常的食品及未经兽医卫生检验或者检验不合格的肉类及其制品(包括病死牲畜肉)。
（4）注意食品的贮藏卫生，防止尘土、昆虫、鼠类等动物及其他不洁物污染食品。