新生儿脐炎最常见的病原体是金黄色葡萄球菌，然后是大肠埃希菌、铜绿假单胞菌和溶血性链球菌。新生儿脐炎一般是脐部在细菌入侵脐周围的蜂窝组织以后引起的脐部炎性感染。多数的孩子可能与脐带结痂的时候脐带残端处理不当，病原微生物入侵体内造成繁殖形成的残端感染。
还有的是在孩子脐带没有完全脱落的时候，大人没有注意做脐部的认真护理，或者污染孩子的脐部造成细菌入侵，也有可能发生脐部感染。有些孩子脐部感染之后有明显的残端红肿伴有脓性分泌物，这时一定要及时带孩子到医院就诊，必要时局部抗感染或者进行脓肿的切开引流，避免因为脐部感染进一步造成败血症。