小儿传染性单核细胞增多症临床上以发热、咽喉痛、肝脾和淋巴结肿大、外周血中淋巴细胞增多并出现异型淋巴细胞等为特征。多数患者有乏力、头痛、畏寒、鼻塞、恶心、食欲减退、轻度腹泻等前驱症状。本病的并发症有脾破裂、自身免疫性溶血性贫血、肝脏损害、心脏损害等。
1、发热：一般均有发热，体温38℃~40℃，无固定热型，热程大多1~2周，少数可达数月。中毒症状多不严重。
2、咽峡炎：绝大多数患儿可表现为咽部、扁桃体、腭垂充血、肿胀，可见出血点，伴有咽痛，部分患儿扁桃体表面可见白色渗出物或假膜形成。咽部肿胀严重者可出现呼吸及吞咽困难。
3、淋巴结肿大：全身淋巴结均可肿大，在病程第一周就可出现。以颈部最为常见。肘部滑车淋巴结肿大常提示有本病的可能。肿大淋巴结直径很少超过3cm，中等硬度，无明显压痛和粘连，肠系膜淋巴结肿大时，可引起腹痛。肿大淋巴结常在热退后数周才消退，亦可数月消退。
4、肝脾大：肝大者约占20%~62%，大多数在肋下2cm以内，可出现肝功能异常，并伴有急性肝炎的上消化道症状，部分有轻度黄疸，约半数患者有轻度脾大，伴疼痛及压痛，偶可发生脾破裂。
5、皮疹：部分患者在病程中出现多形性皮疹，如丘疹、斑丘疹、荨麻疹、猩红热样斑疹、出血性皮疹等，多见于躯干。皮疹大多在4~6日出现，持续一周左右消退。消退后不脱屑，也无色素沉着。