慢性扁桃体炎的症状主要表现为反复的咽痛、发热，此外，还可有咽部不适、异物感、发干、痒、刺激性咳嗽、口臭等。急性发作时可伴有头痛、四肢乏力、容易疲劳或低热等。慢性扁桃体炎。
不但可引起邻近器官的感染，导致中耳炎、鼻窦炎、喉、气管、支气管炎等，更重要的可能成为人体的感染病灶，引起肾炎、关节炎、心内膜炎等全身疾患。
这是因为扁桃体的组织结构与肾脏、关节、心脏等重要器官的结构有相似性。当扁桃体反复感染成为病灶后，会产生抗原抗体复合物，运行于血液中，沉淀在脏器的终末血管区域，并诱发相应器官的炎症反应。