脑部静脉血栓消除是针对血栓本身的抗凝和溶栓，或者机械取栓治疗。从理论上说，可以消除血栓，解除静脉闭塞，恢复血流再通。但是临床上随机对照实验的证据并不多，直到目前这种治疗方法仍然有争议，具体方法也还尚不统一。
抗凝治疗是指给予肝素类抗凝药治疗静脉血栓，可阻止血栓扩大，目的是使闭塞的血管部分或完全再通。抗凝治疗的疗程应根据血栓形成的倾向和复发风险大小而定，一般为3-6个月。
溶栓或机械取栓是对患者进行全身静脉给药的溶栓疗法，或者对于局部进行取栓的疗法。病情严重者经足量抗凝治疗无效，可以进行机械取栓，但远期效果目前还有待评估。