甲状腺疾病可以吃辣椒，但是有些情况需要特别注意，亚急性甲状腺炎是病毒感染相关的自限性疾病，可以表现感染中毒、食欲不振的症状，在治疗期间应该饮食清淡，这样能够更好的有助于消化、恢复。
甲亢患者需要禁碘饮食，含碘丰富的海带、紫菜不让吃，但是辣椒可以食用。
甲亢患者由于高消耗，应该适当增加营养，主食粗细搭配，如新鲜的蔬菜、水果、肉、蛋、奶适当加量。
甲减由于血脂可能增高，建议清淡饮食，少油、少盐、少糖。
桥本甲状腺炎在甲功正常的时候，含碘丰富的饮食不能多吃，因为如果含碘过多，摄入过多就会增加甲减的机会，因此甲状腺疾病都可以吃辣椒，并不影响甲状腺疾病的诊断和治疗。