盐酸多西环素片对怀孕有影响，盐酸多西环素片是四环素类的抗生素，由于可以阻滞骨骼生长发育，影响骨生长，使胎儿的牙齿釉质发育不全，且牙齿变色，所以是妊娠期绝对禁止的药物。另外，有报道妊娠期使用盐酸多西环素片，也会导致孕妇的肝损伤。同样哺乳期也不推荐使用盐酸多西环素片，虽然盐酸多西环素片在哺乳的乳汁中浓度较低，但是理论上存在的牙齿着色和抑制骨生长的可能，也不建议应用于哺乳期。
盐酸多西环素主要的副作用是会引起儿童牙齿的染色及变形，也会引起消化道症状，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻，还可以引起光过敏，也可以引起肾功能损伤加重、皮疹、肝功能异常等。