脑电图检查可用于鉴别脑器质性疾病和功能性疾病，如鉴别抽搐和假性抽搐、器质性还是功能性精神障碍等。
除此之外，还可用于各种脑部疾病辅助诊断、鉴别诊断及定位，如癫痫、脑瘤、脑外伤、颅内血肿、脑炎、脑寄生虫病、脑脓肿、脑血管病及其他各种脑病和危重昏迷的患者。
如果有肿瘤的颅内转移、感染、中毒、肝或肾性疾病等全身疾病，想了解其是否造成脑功能损害也可通过脑电图检查明确。