肺脓肿是一种化脓性炎症，是肺部组织坏死而形成的一种脓腔。其常见的病原菌主要包括厌氧菌，还有一些化脓性细菌，具体主要有具核梭杆菌、坏死梭杆菌、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌肺炎、克雷伯杆菌、铜绿假单胞杆菌。
吸入性肺囊肿大多数为厌氧菌感染，而继发性肺脓肿则以金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌比较常见。血源性肺脓肿则以金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌，以及链球菌比较常见。