婴儿痉挛症为难治性癫痫，预后不良，发作难以控制，多数患儿会遗留智力和运动发育落后的问题，主要治疗方法有以下几方面：
1、药物治疗，如氨己烯酸片口服，已被证明是控制婴儿痉挛症，特别是有结节性硬化症的儿童相当有效的药物；
2、促肾上腺皮质激素肌肉注射，口服抗癫痫药物，例如左乙拉西坦、丙戊酸钠、拉莫三嗪等，大剂量服用维生素B6；
3、生酮饮食，此方法是一个脂肪高比例、碳水化合物低比例、蛋白质和其他营养素合适的配方饮食，既不影响正常的生长发育，同时又具有治疗癫痫等疾病的作用；
4、手术治疗，如果癫痫发作是由局部脑异常引起，可以通过手术治疗。