大部分肺结核的确诊是不困难的。肺结核的确诊国家制定专门的诊断的标准，按照诊断标准的流程，进行痰的结核菌的涂片、结核菌培养，结核菌基因检测，查血的结核抗体、血的γ干扰素释放试验、结核菌素PPD试验，可以确诊大部分的结核病人。再进一步方面的检查，可以做气管镜检查和肺穿刺活检检查，通过以上的检测手段，可以确诊绝大多数的肺结核的病人。对于少数诊断不是很明确的病人，在排除其他肺部疾病的情况下，可以进行诊断性的抗结核的治疗。