异位妊娠的临床治疗方案已是个体化治疗，但不同的治疗方法都有其优点和局限性，临床治疗中需要根据患者的妊娠周数、出血程度及生育状况等因素拟定个体化的治疗方案。病情紧急的需要手术治疗，症状轻微可酌情药物治疗。
一、急症治疗
异位妊娠破裂，有腹腔内大出血、休克的患者医生会及时输液、输血，纠正休克的同时做好急诊手术准备。
二、药物治疗
对于血HCG较低，异位妊娠包块不大的异位妊娠患者，可选择使用米非司酮或是甲氨蝶呤等进行保守治疗。
三、手术治疗
1、腹腔镜手术可以用于输卵管妊娠和腹腔妊娠，可行患侧输卵管切除术或是卵巢部分切除术。
2、宫腔镜手术可以用于宫颈妊娠的治疗，可行宫腔镜下妊娠组织电切术。
四、中医治疗
本病属于血瘀少腹、不通则痛的实证，应以活血化瘀、消症为治则。但对于输卵管间质部妊娠、严重腹腔内出血、保守治疗效果不佳或胚胎继续生长的患者，均不应采取中医治疗，应尽早手术。