病毒感染性腹泻为短期治疗，一般不使用抗病毒药。治疗上主要是针对腹泻和脱水的对症和支持治疗。重症患者需纠正酸中毒和电解质紊乱。
一、药物治疗
1、口服补液盐：轻度脱水及电解质平衡失调可以口服等渗液或世界卫生组织推荐的口服补液盐(ORS)，补液治疗是WHO推荐的首选治疗。米汤加口服补液盐液治疗婴儿脱水很有益。口服补液剂量应是丢失量加上继续丢失量之和的1.5~2.0倍，脱水纠正后应即停服。
2、补锌：慢性病毒性腹泻，尤其是轮状病毒引起婴儿腹泻时，可喂以含轮状病毒抗体的牛奶或母奶，如出现乳糖不耐受情况，应适当限制含乳糖的饮食。由于微量元素锌对肠黏膜有修复作用，补锌能缩短病程，减轻腹泻程度，减低腹泻的再发生，因此应及早补锌。
3、静脉补液：严重脱水及电解质紊乱应静脉补液。脱水情况改善后改为口服。
4、蒙脱石散：WHO推荐蒙脱石散剂用作病毒性腹泻的辅助治疗。尤其对治疗轮状病毒腹泻疗效显著，不良反应小。
5、止吐剂及镇静剂：吐泻较重者，可予以止吐剂及镇静剂。有明显的痉挛性腹痛者，可口服山莨菪碱(654-2)。还可应用抑制肠道分泌的药物，次水杨酸铋制剂及脑啡肽酶抑制剂。
二、手术治疗
此病目前无手术治疗。