慢性肾盂肾炎的症状可以表现为腰部的隐痛、胀痛，或者仅仅是有腰麻、腰胀、腰部不舒服的感觉。另外，大部分病人也没有尿频、尿急、尿痛。慢性肾盂肾炎和急性肾盂肾炎不一样，慢性肾盂肾炎的症状大多数都不典型，并没有典型的腰痛、发热的症状。大多数患者可能有腰部的隐痛、胀痛，甚至连疼痛都没有，有的患者只有腰麻、腰酸、腰胀。也没有典型的尿路刺激症状，没有尿频、尿急、尿痛。
很多患者可能没有下尿路的症状，做尿常规检查的时候，发现尿中可能有一点白细胞，尿中有一点细菌，所以这个时候也应该警惕慢性肾盂肾炎的可能。一般会给病人做肾脏的超声，看看肾脏的形态有没有改变等等，来帮助判断有没有慢性肾盂肾炎。