如果排便频率减少，每周排便少于三次，伴有排便困难、粪便过硬、腹胀不适或排气增多称之为便秘，病程超过六个月的称为慢性便秘。便秘的原因分为器质性便秘和功能性便秘，器质性便秘的原因包括：
1、内分泌和代谢性疾病，包括糖尿病、甲状腺功能减退、高钙血症、高镁血症、低钾血症、低镁血症等等。
2、神经源性病变，如帕金森病、多发性脑梗死、脊柱损伤、多发性硬化症、腰椎间盘疾病、脊柱结核等等。
3、肠道局部病变，如肠道肿瘤造成的狭窄和梗阻、炎症性肠病、肠扭转、憩室等等。
4、药物和食物因素，多种药物可通过影响中枢或肠神经系统、肠道平滑肌改变肠腔内容物成分而导致便秘，如吗啡类、抗胆碱能药物、钙通道阻滞剂和镇静剂等；
5、心理因素，便秘可能是心理疾病的一种症状或治疗药物的不良反应。
除外器质性的疾病就是功能性的便秘，包括慢传输型便秘以及出口梗阻型便秘。