本病的病因是母亲孕期饮酒，母亲在孕期饮酒会对胎儿的发育产生各种不利影响，由于酒精暴露导致胎儿发育受损的严重程度取决于诸多因素，如酒精暴露的量及时间。
1、乙醇为特异性致畸物质，孕妇在妊娠期长期大量饮酒是本病常见的病因。
2、酗酒妇女同时嗜好香烟、咖啡或某些成瘾药物，并常伴营养不良等不利因素，可在乙醇毒性的基础上对胎儿增添附加的损害。