先天性喉蹼可以视患者病情的严重情况而定，如果是轻度患者，可以无需治疗。病情较重患者可以通过手术直接消除病因，配合术后护理，起效快、不反弹，预后很好，根据患者体质完全恢复的时间不同。
1、直接喉镜手术：如果患儿已经出现呼吸困难的症状，可以用喉刀或者喉剪在直接喉镜下切除掉喉蹼组织，术后需要再进行喉扩张术或植入喉模或硅胶片，防止疾病复发。如果没有呼吸困难的症状，则可以等患儿长大以后再进行处理。如果有先天性喉隔或者先天性喉闭锁，已经引起了患儿严重的呼吸困难，则应用3mm的支气管镜穿破喉隔或者闭锁膜，到达气管吸除分泌物，防止窒息，给氧或进行人工呼吸，拯救患者生命。
2、激光切除术：显微喉镜下二氧化碳发光管射出高功率光线对喉蹼进行切除，相较于直接喉镜手术，激光切除术相对简单，且术后不需行喉扩张术，效果较好。