新生儿先天性巨结肠采用经肛巨结肠切除术，患儿取膀胱截石位，齿状线上方处环形切开直肠黏膜，黏膜下游离至盆腔腹膜折返处，切开肌环进入盆腔，边拖出结肠边游离至正常肠段，切段后，近端与直肠黏膜切开处全层吻合。由于新生儿的结肠扩张端短、扩张程度轻，且新生儿乙状结肠系膜长，游离度大，更容易从肛门拖出切除根治。该手术有创伤小、出血少、恢复快、无肠粘连、费用低、可早期实现经口喂养、费用低等优势。