下蹲一会右侧腰部疼痛原因比较多，常见的有：1、腰部疾病。如腰椎不稳定、腰椎间盘突出、腰背肌筋膜炎，脊柱侧弯等。腰部肌肉组织、肌筋膜、韧带等组织炎性改变，或受压或刺激神经水肿，下蹲过久，可能加重病理反应，引起或加重腰疼。2、骶髂关节病变。骶髂关节病变常引起腰骶部疼痛，骶髂关节不稳、损伤等病变可双侧或单侧发病，当右侧病变时，可能出现下蹲时右侧腰疼。3、输尿管结石。输尿管结石发病时患者通常坐卧不宁，辗转反侧，久蹲会导致疼痛加重。4、其他。右侧腰部外伤、感染、肿瘤等。