动脉导管未闭的微创手术后主要有以下几种副作用：
1、用来封堵导管的东西对于人体来说是一种异物，很有可能会导致感染。
2、当这种堵塞物位置不当，出现脱落时，会随着血液循环系统阻塞在身体的各个部位，主要是心脏系统，造成栓塞等严重后果。
3、有时还会出现出血的倾向，但现代医学发展较快，一般动脉导管未闭是需要手术治疗，才能增加存活率的，副作用也在慢慢降低。
一般手术时机常常选在学龄前最佳，因为当随着年龄进一步增大时，手术风险也比较大，所以应该及早进行手术治疗，风险也相对来说比较小，在术后并配合相关抗感染等药物治疗，患儿一般都能较快的恢复。