室间隔缺损微创封堵术在我国属于较常规的手术，成功率高、创伤小。但是任何手术都是有一定的风险，3.9mm属于中度缺损，如果没有明显症状发作可先不手术治疗，观察后期是否可以自行愈合。手术的风险在于术中出现心脏穿孔，发生率1‰，术后可能有血栓形成、房室传导阻滞等并发症，发生率7%，所以手术风险一般不大。手术需要有严格的适应症，对于存在手术禁忌症的病人手术风险大，不宜手术治疗。