精子稀最常见于垂体功能低下，或肾上腺功能不足的病人，会导致内分泌因素引起睾丸生精上皮功能障碍，导致少精症。精子稀还见于左精索静脉曲张的病人，左精索静脉重度曲张时，会导致睾丸温度上升，会影响睾丸曲细精管上皮生成精子。
精子稀还见于自身免疫病病人，当病人发生自身免疫性疾病时，会影响生精上皮脱落，会导致生成精子数量减少，或出现精子稀少症状。精子稀还见于摄入不足，当锌、硒缺乏或微量元素缺乏时，也会导致生精障碍，出现精子稀的症状。染色体缺失时也会导致精子生成障碍，Y染色体缺失会导致生精上皮生成精子障碍，出现精子稀的症状。