尿路感染包括上尿路感染及下尿路感染，致病菌菌谱有所不同，最常见的致病菌为来自肠道的细菌。60%-80%为大肠杆菌。其他还有副大肠杆菌，变形杆菌，葡萄球菌，粪链球菌，产碱杆菌，绿脓杆菌等。此外，还有结核杆菌，淋球菌，衣原体，支原体，滴虫，厌氧菌，原虫或者病毒等。为明确致病菌，在正规的医疗机构做相关检查是非常必要的。