鼻中隔手术是鼻科的常规手术，在全麻鼻窦内窥镜下的微创手术，对于全国各大三级甲等医院来说，鼻中隔的手术风险相对不大。最大的风险在于术后的鼻中隔血肿、鼻中隔脓肿，以及鼻中隔穿孔，但是这种情况的发生率一般是比较低的。
由于手术中止血的不当，或者病人术后用力擤鼻、咳嗽等，会造成伤口出血从而引起鼻中隔血肿。如果血肿没有及时清理、引流出来，就会合并有细菌感染形成鼻中隔的脓肿。鼻中隔脓肿会破坏鼻中隔的黏膜以及软骨，最后形成鼻中隔穿孔。一旦发生鼻中隔穿孔以后，就会造成鼻腔的两侧对通引起呼吸的改变，因此在鼻中隔的手术时应当注意防范这三种术后的并发症。