奋森咽峡炎主要症状为咽痛，因为病变先发生于一侧扁桃体或牙龈，故早期多为一侧咽痛，后期逐渐出现其他不适。
奋森咽峡炎主要症状是咽痛，多为单侧，伴有头痛、背及关节疼痛，全身不适，可伴有发热，口腔有明显的腐败性恶臭，颌下淋巴结肿大，全身症状较轻，并发症较少，常有吞咽困难、头痛、全身不适、背及关节痛，体温一般不超过38.5℃，全身症状较急性扁桃体炎为轻。