宫外孕对身体的危害很大，最主要的危害是因受精卵着床部位不在宫腔，而在输卵管。输卵管管腔狭窄管壁薄，不适合受精卵生长发育，最终导致输卵管的破裂，发生腹腔内大出血，严重时会出现失血性贫血、失血性休克危及生命。患过宫外孕的女性不管是经药物治疗，还是保守手术治疗，以后有可能再次出现宫外孕。
若因宫外孕行根治性手术，需要切除患侧的输卵管，日后怀孕的几率就会降低，甚至有可能不孕，最后宫外孕术后有可能会出现盆腔粘连。只要进行过盆腹腔手术操作的人都有可能发生盆腔粘连，特别是发生了宫外孕妊娠破裂的女性，因为手术或者盆腹腔的积血清理不彻底，有可能发生盆腹腔粘连，出现慢性的盆腔痛。