常用的能够帮助诊断结肠癌和判断结肠癌预后的肿瘤标志物，包括癌胚抗原、糖类抗原199、糖类抗原242等。其中癌胚抗原对结肠癌诊断中并不是特别敏感，在临床上主要用于结肠癌的病情监测、疗效判断和预后的评估；糖类抗原199在各种的结肠腺癌中都可以升高，与结肠癌的侵袭和转移密切相关；糖类抗原242是一种消化道肿瘤相关抗原，当细胞出现恶变增生的时候，这个指标可以显著地增加。