消化不良会出现上腹疼痛、早饱、嗳气、腹胀、腹泻等症状，消化不良主要是由于胃肠蠕动功能缓慢，食物不能被及时排空导致。这类患者在摄入食物后由于食物不能及时被胃内排空，因此会在胃内滞留一段时间，食物在胃内滞留时会产生大量气体，不仅会对胃壁造成刺激引起上腹部疼痛，同时还会出现早饱的症状。
患者在少量摄入一些食物之后就会出现饱胀感，由于食物在胃内滞留过程中产生大量气体，在腹内压力作用下气体会通过食管释放出来，这时患者就会出现嗳气的症状。食物进入肠道，由于其中含有大量没有被消化的食物，因此会和肠道中的菌群发生反应产生大量气体，患者会出现腹胀感。由于肠道功能出现损伤，不能将食物的营养和水分吸收，所以大多数患者会伴随有腹泻。