通过临床症状、影像学、实验室检查可确诊胃神经官能症。平常不注意饮食健康、精神压力增大，胃炎、胃溃疡等一些慢性的疾病，会导致胃神经官能症的出现。患者出现疾病后会表现为消化道方面的症状，如神经性的呕吐、厌食、嗳气、上腹部疼痛、肠鸣、腹泻、便秘等症状。
一旦出现以上临床表现可及时到医院的消化内科进行影像学的检查，主要通过X线、内镜、超声、CT进行检查基本就可以确诊。进行胃肠道X线检查的时候能显示整个胃肠道的运动加速、结肠袋加深、张力增强，由于结肠部位痉挛，降结肠以下还会出现线样阴影。同时还应配合血常规、肝肾功能、免疫因子等一些实验室方面检查，必要时可做局部组织病检。