首先，再障是个良性疾病，不会转变成为骨髓增生异常综合征（MDS）、白血病。低增生性的MDS在临床表现上可以出现白细胞、血红蛋白及血小板减少，跟再障相似，但是其细胞形态可见到病态造血，部分类型可见到原始细胞，此病有高度转化为急性白血病的风险。在基因方面，MDS可出现染色体异常，而再障基本不会出现异常染色体。治疗上，MDS主要靠化疗，而再障首选免疫抑制治疗，二者也都是骨髓移植的适应症。